家里已有自建房，市区的经济适用房购买后自建

法律分析：首先自建房是可以办理不动产证的，只是在办理自建房不动产证之前要满足到一定的条件。因为农村自建房的宅基地是需要通过审批的，所以农村的自建房不动产证的办理也会不同于城里的房子先买房然后再去办证的。而是需要先提出书面的申请，通过了审批以后，才可以建房再办理不动产证。其实在农村己经建好的住房还能不能办理不动产证的关键在于房屋的性质，如果是农村集体就是我们说的小产权房就是不能够办理不动产证的，建房时国家是没有进行批准的，属于违规建筑，所以是不能够办理不动产证的。还有一个最关键的问题就是自建房是否拥有了宅基地的使用权证，农村的自建房也是需要领取到房屋产权证的，而在我们国家的农村还有很多房子是没有房产证也就是不动产证，只办理了登记的手续。如果可以办理到不动产证就需要在建房之前，要先取得批件的许可。然后，带上土地证和准建证到房管局办理不动产证即可。
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建议到住建局询问
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建议到房管部门询问